มูลนิธิเซนต์ฟรัง 35 เกิดจากการริเริ่มของนายประณัย  สัตยวณิช นายกสมาคมผู้ปกครองฯ คณะกรรมการและคณะครูโรงเรียนเซนต์ฟรังซีสซาเวียร์คอนแวนต์ ซึ่งต่างตระหนักถึงความสำคัญของเงินทุนถาวรเพื่อสนับสนุนส่งเสริมกิจกรรมต่างๆ และการพัฒนาบุคลากรของโรงเรียน รวมทั้งสามารถให้การช่วยเหลือสนับสนุนสาธารณกุศลทั่วไป  จึงได้จัดตั้งมูลนิธิเซนต์ฟรัง 35 เพื่อตั้งเป็นกองทุนและนำดอกผลมาใช้ในกิจการของโรงเรียน เป็นการแบ่งเบาภาระของสมาคมผู้ปกครองฯ โดยมี นายสมชาย จันทวังโส เป็นผู้ร่างกฎข้อบังคับของมูลนิธิฯ และมีรายนามคณะกรรมการผู้ริเริ่มในการขอจัดตั้งมูลนิธิเซนต์ฟรัง 35 ดังนี้

1. นายประณัย สัตยวณิช
2. นายสมชาย จันทวังโส
3. พ.ต.ต.ธานินทร์ เย็นวอน
4. นางสุวรรณา สันติกุล

พ.ต.ต.ธานินทร์  เย็นวอน เป็นผู้ดำเนินการขออนุญาตจดทะเบียนจัดตั้งมูลนิธิโดยถูกต้องตามกฎหมาย และได้รับอนุญาตให้จัดตั้งมูลนิธิเซนต์พรัง 35 จากสำนักงานวัฒนธรรมแห่งชาติ เมื่อวันที่ 26 มีนาคม 2535 และได้รับหนังสือนุญาตให้ดำเนินงานมูลนิธิเซนต์พรัง 35  จากศาลาว่าการกรุงเทพมหานคร เมื่อวันที่ 4 ตุลาคม 2536

สมาคมผู้ปกครองและครูเซนต์ฟรังซีลซาเวียร์ ร่วมกับโรงเรียนเซนต์ฟรังซีสซาเวียร์คอนแวนต์ และสมาคมศิษย์เซนต์ฟรังซีสซาเวียร์ในพระบรมราชินูปถัมภ์ ร่วมกันจัดงานเดินเทิดพระเกียรติ สมเด็จพระนางเจ้าสิริกิติ์ พระบรมราชินีนาถ โดยมี นายสมชาย  จันทวังโส เป็นประธานการจัดงาน รายได้จากการจัดงานครั้งนี้แบ่งออกเป็น 3 ส่วน ซึ่งส่วนหนึ่งนำมาตั้งเป็นกองทุนเฉลิมพระเกียรติ เพื่อประเดิมในการขอรับการจัดตั้งมูลนิธิเซนต์ฟรัง 35

รายนามประธานกรรมการบริหารมูลนิธิเซนต์ฟรัง 35

1. นายประณัย          สัตยวณิช                   ดำรงตำแหน่ง พ.ศ.2535
2. นายสมชาย           จันทวังโส                   ดำรงตำแหน่ง พ.ศ.2536 – พ.ศ. 2548
3. นายธนะศักดิ์         ธนิตานนท์                 ดำรงตำแหน่ง พ.ศ.2548 – พ.ศ.2558
4. นายส่วน                ดวงจันทร์                  ดำรงตำแหน่ง พ.ศ.2558 – ปัจจุบัน