สมาคมศิษย์เซนต์พรังชีสซาเวียร์ในพระบรมราชินูปถัมภ์ได้เริ่มก่อตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 14 มีนาคม 2515 โดยเซฮร์ เรอเน เดอ เยซู สุขดารา อธิการิณีได้ให้การสนับสนุนให้มีการชุมนุมศิษย์เก่า และเลือกผู้แทนรุ่นมาประชุมพิจารณาก่อตั้งสมาคมขึ้น โดยมีท่านผู้หญิงนวลผ่อง เสนาณรงค์ นายกสมาคมศิษย์ฯ คนแรก และได้จดทะเบียนก่อตั้งสมาคมฯ ในวันที่ 19 เมษายน 2515 ที่ทำการของสมาคมตั้งอยู่ที่ชั้น 2 อาคารมิตราคม

วันที่ 9 กุมภาพันธ์ 2516 สมเด็จพระนางเจ้าสิริกิติ์ พระบรมราชินีนาถ เสด็จพระราชดำเนินทรงเปิดตึกมิตราคม ทรงเจิมป้าย “สมาคมศิษย์เซนต์ฟรังฯ” ณ โรงเรียนเซนต์ฟรังซีสซาเวียร์คอนแวนต์

วันที่ 15 มีนาคม 2518 สมเด็จพระนางเจ้าฯ พระบรมราชินีนาถ ทรงพระกรุณาโปรดเกล้าโปรดกระหม่อมรับสมาคมศิษย์เซนต์ฟรังซีสซาเวียร์ เข้าอยู่ในพระบรมราชินูปถัมภ์ ทำให้สมาคมเปลี่ยนชื่อเป็น “สมาคมศิษย์เซนต์พรังชีสซาเวียร์ในพระบรมราชินูปถัมภ์” ตั้งแต่บัดนั้นเป็นต้นมา

วัตถุประสงค์ของสมาคมศิษย์ฯ

1. เพื่อส่งเสริมมิตรภาพและความสามัคคี ระหว่างศิษย์เซนต์ฟรังฯ
2. เพื่อส่งเสริมความรู้และแลกเปลี่ยนความคิดเห็นซึ่งกันและกัน
3. เพื่อประกอบกิจการอันเป็นประโยชน์แก่ครู นักเรียน และโรงเรียน ตลอดจนกิจกรรมอันเป็น สาธารณกุศล
4. เพื่อประสานงานกับองค์กรอื่นๆ ในทางที่จะทำให้สำเร็จวัตถุประสงค์ดังกล่าวข้างต้น

สมาคมศิษย์เซนต์พรังชีสซาเวียร์ในพระบรมราชินูปถัมภ์ ได้ประกอบกิจกรรมอันเป็นประโยชน์แก่โรงเรียน ศิษย์เก่า ศิษย์ปัจจุบัน และกิจกรรมอันเป็นสาธารณกุศลตลอดมา ตั้งแต่เริ่มก่อตั้งจนถึงปัจจุบัน โดยมีนายกสมาคมศิษย์ฯ ดังนี้

1. ท่านผู้หญิงนวลผ่อง       เสนาณรงค์                    ดำรงตำแหน่ง พ.ศ. 2515 – 2519
2. คุณเฉลิมขวัญ                นิวาตวงค์                       ดำรงตำแหน่ง พ.ศ. 2519 – 2521
3. คุณหญิงสุปรียา             ประวิตร ณ อยุธยา        ดำรงตำแหน่ง พ.ศ. 2521 – 2523
4. คุณประไพพันธ์             สุขุมวาท                        ดำรงตำแหน่ง พ.ศ. 2523 – 2529
5. คุณปรางทิพย์                ทวีพาณิชย์                    ดำรงตำแหน่ง พ.ศ. 2529 – 2537
6. คุณกรณิการ์                   ทวีทรัพย์                       ดำรงตำแหน่ง พ.ศ. 2537 – 2543
7. คุณหญิงทิพาวดี             เมฆสวรรค์                    ดำรงตำแหน่ง พ.ศ. 2543 – 2547
8. รศ. ดร.พิชนี                   โพธารามิก                    ดำรงตำแหน่ง พ.ศ. 2547 – 2549
9. คุณหญิงปัทมา               ลีสวัสดิ์ตระกูล               ดำรงตำแหน่ง พ.ศ. 2549 – 2557
10. พันเอกหญิงอัญพร        หิญชีระนันทน์               ดำรงตำแหน่ง พ.ศ. 2557 – 2560
11. คุณจันทนา                    ปัญญาดิลก                   ดำรงตำแหน่ง พ.ศ. 2560 – 2562
12. คุณนิรัชรา                     ศิริอำพันธ์กุล                ดำรงตำแหน่ง พ.ศ. 2562 – 2565
13. ดร.ศศมณฑ์                   สงวนสิน                       ดำรงตำแหน่ง พ.ศ. 2565 – 2569
14. พล.ร.ต.หญิง.จีระวัฒน์ กฤษณพันธ์ ว่องวิทย์    ดำรงตำแหน่ง พ.ศ. 2569 – ปัจจุบัน